Автономное образовательное учреждение дополнительного образования детей Вологодской области «Региональный центр дополнительного образования детей» создано 24 апреля 2013 года путем реорганизации в форме слияние Бюджетного образовательного учреждения дополнительного образования детей Вологодской области «Областной центр детского и юношеского туризма и экскурсий», Бюджетного образовательного учреждения дополнительного образования детей Вологодской области «Областной центр внешкольной (спортивно-массовой) работы» и Бюджетного образовательного учреждения дополнительного образования детей Вологодской области «Областная станция юных натуралистов». Постановлением Правительства Вологодской области от 14.08.2017 года № 738 АОУ ДО ВО "Региональный центр дополнительного образования детей" стало выполнять функции Регионального модельного центра центра дополнительного образования детей Вологодской области. В 2022 году у АОУ ДО ВО "Региональный центр дополнительного образования детей" появилось структурное подразделение Центр выявления, поддержки и развития способностей и талантов детей и молодежи Вологодской области «Импульс».